——习在致中国科学院建院70周年贺信中作出的“两加快一努力”重要指示要求
1949年，伴随着新中国的诞生，中国科学院成立。作为国家在科学技术方面的最高学术机构和全国自然科学与高新技术的综合研究与发展中心，建院以来，中国科学院时刻牢记使命，与科学共进，与祖国同行，以国家富强、人民幸福为己任，人才辈出，硕果累累，为我国科技进步、经济社会发展和国家安全做出了不可替代的重要贡献。更多简介 +
中国科学院院级科技专项体系包括战略性先导科技专项、重点部署科研专项、科技人才专项、科技合作专项、科技平台专项5类一级专项，实行分类定位、分级管理。
为方便科研人员全面快捷了解院级科技专项信息并进行项目申报等相关操作，特搭建中国科学院院级科技专项信息管理服务平台。了解科技专项更多内容，→
中国科学技术大学（简称“中国科大”）于1958年由中国科学院创建于北京，1970年学校迁至安徽省合肥市。中国科大坚持“全院办校、mgty芒果体育所系结合”的办学方针，是一所以前沿科学和高新技术为主、兼有特色管理与人文学科的研究型大学。
中国科学院大学（简称“国科大”）始建于1978年，其前身为中国科学院研究生院，2012年经教育部批准更名为中国科学院大学。国科大实行“科教融合”的办学方针，与中国科学院直属研究机构（包括所、院、台、中心等），在管理体制、师资队伍、培养体系、科研工作等方面高度融合，是一所以研究生教育为主的独具特色的高等学校。
上海科技大学（简称“上科大”），由上海市人民政府与中国科学院共同举办、共同建设，由上海市人民政府主管，2013年经教育部正式批准。上科大致力于服务国家经济社会发展战略，培养科技创新创业人才，努力建设一所小规模、高水平、国际化的研究型、创新型大学。
在合成生物学与工业生物制造领域，密码子优化是提升外源基因表达水平的关键环节。然而，传统方法往往依赖高频密码子替换，这一策略虽然能够在一定程度上提高表达效率，但可能破坏自然序列中与蛋白折叠和翻译动力学相关的“稀有密码子簇”，产生不表达或低表达现象。
近日，mgty芒果体育中国科学院天津工业生物技术研究所研究员江会锋团队在密码子优化研究方面取得进展。研究团队开发出基于深度学习的密码子优化模型DeepCodon。该模型在提升密码子偏好性的同时，尽可能保留功能相关的稀有密码子特征，为工程菌株序列设计提供了新思路。
DeepCodon以人工智能学习密码子选择规律为基础，建立从蛋白质到编码序列的“翻译映射”。在大规模序列数据训练的基础上，mgty芒果体育研究团队对高表达基因进行微调，使模型在生成合理密码子序列的同时能够兼顾高表达性能。进一步，DeepCodon引入条件概率策略，优先保护进化上保守、与功能相关的稀有密码子簇，避免传统方法过度使用高频密码子带来的翻译拥堵和错误折叠风险。
在实验验证中，研究团队分别利用DeepCodon与传统方法优化20个基因，并在大肠杆菌中表达。结果显示，9个DeepCodon优化基因表达高于传统方法，10个基因与传统方法相当，仅1个基因低于传统方法。目前，该工具主要面向大肠杆菌应用场景，并提供免费在线密码子优化服务。
相关成果已发表在《生物设计研究》（BioDesign Research）上。研究工作得到国家自然科学基金和中国科学院战略性先导科技专项的支持。
在合成生物学与工业生物制造领域，密码子优化是提升外源基因表达水平的关键环节。然而，传统方法往往依赖高频密码子替换，这一策略虽然能够在一定程度上提高表达效率，但可能破坏自然序列中与蛋白折叠和翻译动力学相关的“稀有密码子簇”，产生不表达或低表达现象。近日，中国科学院天津工业生物技术研究所研究员江会锋团队在密码子优化研究方面取得进展。研究团队开发出基于深度学习的密码子优化模型DeepCodon。该模型在提升密码子偏好性的同时，尽可能保留功能相关的稀有密码子特征，为工程菌株序列设计提供了新思路。DeepCodon以人工智能学习密码子选择规律为基础，建立从蛋白质到编码序列的“翻译映射”。在大规模序列数据训练的基础上，研究团队对高表达基因进行微调，使模型在生成合理密码子序列的同时能够兼顾高表达性能。进一步，DeepCodon引入条件概率策略，优先保护进化上保守、与功能相关的稀有密码子簇，避免传统方法过度使用高频密码子带来的翻译拥堵和错误折叠风险。在实验验证中，研究团队分别利用DeepCodon与传统方法优化20个基因，并在大肠杆菌中表达。结果显示，9个DeepCodon优化基因表达高于传统方法，10个基因与传统方法相当，仅1个基因低于传统方法。目前，该工具主要面向大肠杆菌应用场景，并提供免费在线密码子优化服务。相关成果已发表在《生物设计研究》（BioDesign Research）上。研究工作得到国家自然科学基金和中国科学院战略性先导科技专项的支持。蛋白表达密码子优化服务论文链接DeepCodon示意图
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